廣州健康院高度重視科普工作，利用科研、人才和平台設施等方麵的優勢，多年來堅持開展多種科普活動，積極搭建研學與實驗探究相結合的科普平台，尤其在整合粵港澳大灣區科普資源、構建科學與教育融合的科普體係等方麵做出了有益的探索。曾獲得“2018年科普啟明星（機構）”榮譽稱號。在中科院廣州分院的大力支持下，廣州健康院還聯合有關單位成立少年科考隊，與廣州市玉岩中學、廣州科學城中學、廣州市黃埔區玉泉學校等開展深度廣泛的科普合作，也在連南縣渦水鎮中心學校啟動“種下一顆科學的種子 科普助力鄉村振興”三年科普行動計劃。

廣州健康院將落實科普基地的作用和義務，充分發揮自身的科普資源優勢，做好向公眾開放、講解等服務，積極開展和參與各類科普活動，為提高社會公眾的科學文化素質更好地發揮作用，為促進“科技創新”與“科學普及”的兩翼齊飛繼續貢獻自己的力量。